La PCR digitale (dPCR) è una tecnica che divide il sistema di reazione PCR in un gran numero di minuscole unità di reazione (come goccioline, microcamere, ecc.), garantendo che ciascuna unità contenga solo 0, 1 o poche molecole bersaglio. Successivamente, ciascuna unità viene amplificata in modo indipendente e viene contato il numero di unità positive, ottenendo così una quantificazione assoluta delle molecole di acido nucleico target.

 

Domande frequenti

 

D: Quali sono i vantaggi della PCR digitale rispetto alla qPCR?

R: Vantaggi principali della PCR digitale rispetto alla qPCR
I cinque vantaggi principali della PCR digitale
Tutti questi vantaggi derivano dal principio fondamentale del "partizionamento" e del "conteggio assoluto degli endpoint".
1. Quantificazione assoluta senza curva standard
2. Sensibilità ultra-elevata e rilevamento di varianti rare
3. Precisione e riproducibilità superiori
4. Maggiore tolleranza agli inibitori della PCR
5. Indipendenza dall'efficienza di amplificazione

D: PCR digitale, qPCR ed emocoltura per il confronto nel rilevamento di infezioni del sangue

A:

Caratteristica PCR digitale qPCR Emocoltura
Principio fondamentale Conteggio assoluto degli acidi nucleici endpoint Quantificazione relativa degli acidi nucleici relativi in ​​tempo reale- Crescita e coltivazione microbica
Obiettivo di rilevamento Acidi nucleici specifici dell'agente patogeno-(DNA/RNA) Acidi nucleici specifici dell'agente patogeno-(DNA/RNA) Microrganismi vitali e coltivabili
Tempo di consegna Veloce (Il nostro TAT 3 ore) Veloce

Ma Filmarray BCID2 si basa su emocolture positive

Lento (2-5 giorni, media . 24-48 ore)
Sensibilità Eccezionalmente alto (livello-copia singola) Alto Lower (requires >10-100 UFC/mL)
Quantificazione Assoluto (copie/mL) Relativo (valore Ct, necessita di curva standard) Semi-quantitativo (tempo-alla-positività, conteggio delle colonie)
Effetto degli antibiotici Nessun effetto (rileva l'acido nucleico da organismi vivi/morti) Nessun effetto (rileva l'acido nucleico da organismi vivi/morti) Impatto grave (gli antibiotici precedenti possono causare falsi negativi)
Tolleranza agli inibitori Eccellente, altamente tollerante agli inibitori del sangue Più debole, suscettibile agli inibitori del sangue N/A, ma soggetto a inibizione microbica
Copertura degli agenti patogeni Mirato, richiede una sequenza nota Mirato, richiede una sequenza nota Ampio-spettro imparziale, in grado di rilevare agenti patogeni sconosciuti/rari
Valore clinico primario Diagnosi precoce, precisa e quantitativa Questa tecnologia è ampiamente applicata in scenari basati su campioni di emocolture positive. Diagnosi definitiva e guida terapeutica (Gold Standard, Slow)

 

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